MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 34733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017308	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
2	NC_017308	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
3	NC_017308	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	387139675
4	NC_017308	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
5	NC_017308	TGCA	2	8	275	282	25 %	25 %	25 %	25 %	387139675
6	NC_017308	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
7	NC_017308	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139675
8	NC_017308	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	387139675
9	NC_017308	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139675
10	NC_017308	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
11	NC_017308	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	387139675
12	NC_017308	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
13	NC_017308	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	387139675
14	NC_017308	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
15	NC_017308	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	387139675
16	NC_017308	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139675
17	NC_017308	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
18	NC_017308	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
19	NC_017308	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	387139675
20	NC_017308	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	387139675
21	NC_017308	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	387139675
22	NC_017308	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	387139675
23	NC_017308	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139675
24	NC_017308	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
25	NC_017308	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
26	NC_017308	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	387139675
27	NC_017308	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
28	NC_017308	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	387139675
29	NC_017308	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
30	NC_017308	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139675
31	NC_017308	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139675
32	NC_017308	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
33	NC_017308	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
34	NC_017308	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
35	NC_017308	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	387139675
36	NC_017308	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	387139675
37	NC_017308	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	387139675
38	NC_017308	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
39	NC_017308	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
40	NC_017308	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
41	NC_017308	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
42	NC_017308	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139675
43	NC_017308	GAAG	2	8	2429	2436	50 %	0 %	50 %	0 %	387139676
44	NC_017308	CCCA	2	8	2484	2491	25 %	0 %	0 %	75 %	387139676
45	NC_017308	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
46	NC_017308	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
47	NC_017308	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139676
48	NC_017308	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139676
49	NC_017308	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
50	NC_017308	CTGC	2	8	2769	2776	0 %	25 %	25 %	50 %	387139676
51	NC_017308	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139676
52	NC_017308	TC	3	6	3005	3010	0 %	50 %	0 %	50 %	387139676
53	NC_017308	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139676
54	NC_017308	GAAA	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	387139676
55	NC_017308	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139676
56	NC_017308	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139676
57	NC_017308	TTAC	2	8	3398	3405	25 %	50 %	0 %	25 %	387139676
58	NC_017308	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139676
59	NC_017308	TCGT	2	8	3683	3690	0 %	50 %	25 %	25 %	387139677
60	NC_017308	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139677
61	NC_017308	AT	3	6	3782	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	387139677
62	NC_017308	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139677
63	NC_017308	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139677
64	NC_017308	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139677
65	NC_017308	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139677
66	NC_017308	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139677
67	NC_017308	A	6	6	4463	4468	100 %	0 %	0 %	0 %	387139677
68	NC_017308	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139677
69	NC_017308	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139677
70	NC_017308	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139677
71	NC_017308	AAGG	2	8	4839	4846	50 %	0 %	50 %	0 %	387139677
72	NC_017308	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139678
73	NC_017308	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139678
74	NC_017308	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139678
75	NC_017308	TC	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	387139678
76	NC_017308	A	6	6	5024	5029	100 %	0 %	0 %	0 %	387139678
77	NC_017308	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139678
78	NC_017308	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139678
79	NC_017308	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	387139678
80	NC_017308	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139678
81	NC_017308	AC	3	6	5199	5204	50 %	0 %	0 %	50 %	387139678
82	NC_017308	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139678
83	NC_017308	ATAC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	387139678
84	NC_017308	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	387139679
85	NC_017308	GTGGA	2	10	5772	5781	20 %	20 %	60 %	0 %	387139679
86	NC_017308	ATGC	2	8	5816	5823	25 %	25 %	25 %	25 %	387139679
87	NC_017308	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
88	NC_017308	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
89	NC_017308	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139679
90	NC_017308	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139679
91	NC_017308	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139679
92	NC_017308	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
93	NC_017308	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
94	NC_017308	A	6	6	6261	6266	100 %	0 %	0 %	0 %	387139679
95	NC_017308	CCGATG	2	12	6273	6284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387139679
96	NC_017308	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
97	NC_017308	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
98	NC_017308	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
99	NC_017308	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139679
100	NC_017308	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
101	NC_017308	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
102	NC_017308	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
103	NC_017308	CG	3	6	6577	6582	0 %	0 %	50 %	50 %	387139679
104	NC_017308	AATCT	2	10	6609	6618	40 %	40 %	0 %	20 %	387139679
105	NC_017308	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139679
106	NC_017308	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139679
107	NC_017308	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
108	NC_017308	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139679
109	NC_017308	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
110	NC_017308	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139679
111	NC_017308	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
112	NC_017308	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139679
113	NC_017308	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139679
114	NC_017308	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
115	NC_017308	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139679
116	NC_017308	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
117	NC_017308	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
118	NC_017308	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
119	NC_017308	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
120	NC_017308	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139680
121	NC_017308	T	6	6	7804	7809	0 %	100 %	0 %	0 %	387139680
122	NC_017308	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139680
123	NC_017308	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139680
124	NC_017308	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139680
125	NC_017308	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139680
126	NC_017308	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139680
127	NC_017308	AT	5	10	8127	8136	50 %	50 %	0 %	0 %	387139680
128	NC_017308	ATT	2	6	8300	8305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139681
129	NC_017308	GCG	2	6	8720	8725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139682
130	NC_017308	TGA	2	6	8806	8811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139682
131	NC_017308	GCT	2	6	8823	8828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139682
132	NC_017308	CGA	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
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134	NC_017308	GAG	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139683
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261	NC_017308	CG	3	6	17221	17226	0 %	0 %	50 %	50 %	387139689
262	NC_017308	TTA	2	6	17246	17251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139689
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500	NC_017308	CTGA	2	8	31868	31875	25 %	25 %	25 %	25 %	387139704

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